Análisis de la variabilidad genética de cepas de norovirus y rotavirus identificadas en México

Abstract

Introducción. La gastroenteritis aguda (GA) es un proceso inflamatorio de la mucosa gástrica e intestinal, anualmente se reportan 1.5 billones de episodios y 1.5-2.5 millones de muertes en niños menores de 5 años. Se estima que al menos el 80% de los casos son debido a una infección por rotavirus, siendo norovirus la segunda causa de GA. Objetivo. Analizar la variabilidad genética de las proteínas asociadas con la virulencia de cepas de norovirus y rotavirus identificadas en muestras de origen biológico. Materiales y métodos. Se realizó un estudio de tipo transversal, descriptivo y observacional, con un muestreo a conveniencia de heces de individuos de Culiacán. Se obtuvo el material genético de las muestras y se realizó la identificación de rotavirus mediante RT-PCR con primers. Se obtuvieron cepas previamente reportadas en el GenBank, de las proteínas virales estructurales y no estructurales de cepas de norovirus y rotavirus identificadas en México. Se evaluó la antigenicidad de las proteínas utilizando la herramienta en línea VaxiJen v.2.0. se realizó la predicción de epítopos contra células B y T utilizando las herramientas ABCpred y HLApred respectivamente y se evaluó la toxicidad y alergenicidad con las herramientas ToxinPred y AllergenFP v.1.0, respectivamente Resultados. Se encontró una frecuencia de rotavirus del 4%, el análisis de las secuencias reportadas en México evidencia a norovirus GII.P4 y GII.4 como los más frecuente en México, en el caso de rotavirus fueron el genotipo G9 y P[4]. Se identificaron epítopos de norovirus y rotavirus como posibles candidatos para el desarrollo de una vacuna.